Осветление бульона микробов может включать в себя удаление клеток-хозяев из посева в ферментере для получения внеклеточных белков, которые потом извлекаются из фильтрата. В случае внутриклеточных белков клетки отделяют от посева и лизируются, а лизат затем очищается, чтобы удалить остатки клеток и других загрязняющих веществ перед последующей обработкой.
